Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXA13P31271 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXA13P31271 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms