Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMA3P25788 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMA3P25788 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms