Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CD247P20963 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CD247P20963 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CD247P20963 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD247P20963 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD247P20963 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms