Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LMNB1P20700 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LMNB1P20700 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms