Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms