Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC2P18074 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms