Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms