Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MS4A1P11836 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms