Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CD8BP10966 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms