Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC192P0DO97 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms