Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PKHD1P08F94 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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