Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CTSLP07711 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms