Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHDP01880 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHDP01880 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHDP01880 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHDP01880 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHDP01880 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms