Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTAP01374 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LTAP01374 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTAP01374 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms