Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DDX58O95786 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DDX58O95786 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms