Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1AO95602 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1AO95602 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms