Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIT2O94813 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIT2O94813 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms