Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD4O60885 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRD4O60885 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRD4O60885 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRD4O60885 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BRD4O60885 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms