Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYNGR3O43761 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms