Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H7C1D1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H7C1D1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H7C1D1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H7C1D1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H7C1D1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H7C1D1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms