Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms