Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CFAP73A6NFT4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CFAP73A6NFT4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms