Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF316A6NFI3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF316A6NFI3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms