Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IGKV2-40A0A087WW87 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
IGKV2-40A0A087WW87 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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