Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC61Q9Y6R9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms