Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SNX8Q9Y5X2 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms