Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLF13Q9Y2Y9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms