Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KCNIP3Q9Y2W7 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP3Q9Y2W7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP3Q9Y2W7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP3Q9Y2W7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP3Q9Y2W7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KCNIP3Q9Y2W7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms