Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MRPS28Q9Y2Q9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MRPS28Q9Y2Q9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms