Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DTX4Q9Y2E6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms