Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms