Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
IGSF9BQ9UPX0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms