Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAK1Q9UPV9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAK1Q9UPV9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms