Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDZRN3Q9UPQ7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms