Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COPS3Q9UNS2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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