Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF608Q9ULD9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZNF608Q9ULD9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms