Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TSR3Q9UJK0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms