Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MBD1Q9UIS9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MBD1Q9UIS9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms