Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLKQ9UBT6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms