Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DKK3Q9UBP4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms