Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NLKQ9UBE8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NLKQ9UBE8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms