Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MBD2Q9UBB5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MBD2Q9UBB5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms