Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U8

SLC17A6, Vesicular glutamate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A6Q9P2U8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC17A6Q9P2U8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms