Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LRP2BPQ9P2M1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms