Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TOR4AQ9NXH8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TOR4AQ9NXH8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms