Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MED17Q9NVC6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms