Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TMEM106BQ9NUM4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms