Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB9BQ9NP90 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms