Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD42

CHMP1A, Charged multivesicular body protein 1a, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1AQ9HD42 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CHMP1AQ9HD42 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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