Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MIXL1Q9H2W2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms